2008年11月17日月曜日

R の pvclust をより詳細に

R はとっても便利なツール。

意味を理解していなくても(ォィォィ)、10月30日のエントリのようなことが数行でできる。
ただし、plot(ma.pv) なんてことをやって見てもどうしてそういう絵がプロットすることが
できるのかはいまいちよくわからない。。。

そんな時は、ma.pv$hclust をするともう少し世界が広がる。
pvclust は、hclust を継承(?)しているので、hclust で出来ることが pvclust でもできる。
つまり、hclust$height や hclust$labels 等々により、どうして plot(ma.pv) という
絵が出来るのかがわかるようになる。

help(pvclust)

をすれば出てくるんだけど、あまりウェブには情報がなかったような気がするので、
簡単にヒントになりそうな情報だけ残しておく。

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